Muziek zit Jan van kinds af aan in het bloed, zelfs tijdens zijn vrije tijd is hij er altijd mee bezig. Toen hij nog lesgaf was hij muzikant bij het kinderkoor Pandoertjes in Balgerhoeke. Daar was hij ook drie jaar organist van de kerk. In de jaren ’80 en tot 2007 was hij er dirigent van kerkkoor Balcanto.
Jan volgde in 2008 Johan De Kesel op als dirigent van Canticorum in Adegem en hij is ook dirigent bij het Meetjeslands Zanggenootschap.
In 2023 scheerde hij als dirigent hoge toppen toen hij met het gemengd koor Canticorum drie keer op rij C.C. Den Hoogen Pad liet vollopen met ‘Canticorum zingt Tura’.
Daarnaast scoorde Jan Wauters vorig jaar ook met het ‘Warmhoflied’ dat hij n.a.v. de Wereld dementiedag componeerde voor het woonzorgcentrum Warmhof, waar hij ook dirigent is van het ‘Geheugenkoor’.
Ten slotte sloot hij met Canticorum i.s.m. kinderkoor De Papaver 2023 af met drie uitverkochte Kerstconcerten.